SnapGene Viewer正式版
SnapGene Viewer正式版是款適合從事化學(xué)行業(yè)的用戶使用的質(zhì)粒圖譜繪制工具。SnapGene Viewer能夠用來(lái)繪制質(zhì)粒圖譜,并創(chuàng)建、瀏覽、注釋以及分享DNA序列文件。SnapGene Viewer經(jīng)常被用于創(chuàng)建和共享豐富的注釋序列文檔,可查看多種格式的文件。華軍軟件園提供SnapGene Viewer軟件的下載服務(wù),下載SnapGene Viewer軟件其他版本,請(qǐng)到華軍軟件園!- 綠色版查看
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SnapGene Viewer軟件功能
一、可視化
1、創(chuàng)建一個(gè)DNA序列文件,要么輸入一個(gè)序列,要么從GenBank中導(dǎo)入一個(gè)記錄,或者打開一個(gè)存儲(chǔ)在許多常見(jiàn)文件格式中的注釋序列。
2、使用可定制的地圖、序列、酶、特征、引物和歷史視圖瀏覽或打印DNA序列及其注釋。
3、搜索DNA序列以匹配DNA查詢、蛋白質(zhì)翻譯或注釋。
4、查看和編輯DNA序列跟蹤。
二、注釋
1、自動(dòng)注釋公共特性,或手動(dòng)注釋編碼序列和其他特性。
2、設(shè)計(jì)、注釋引物進(jìn)行PCR、測(cè)序或誘變。
3、確定的開放閱讀框(ORF)與一個(gè)單一的點(diǎn)擊鼠標(biāo)。
三、分享
1、將質(zhì)粒映射導(dǎo)出為圖像,或者導(dǎo)出注釋后的DNA序列到GenBank格式。
2、自由分享數(shù)據(jù)與你的同事或客戶使用普遍可訪問(wèn)的snapgene格式。
SnapGene Viewer軟件特色
輕松計(jì)劃和模擬DNA操作
自動(dòng)記錄在克隆項(xiàng)目的步驟
與其他研究人員共享注明的序列文件
可視化的ORF閱讀框,和引物結(jié)合位點(diǎn)。
SnapGene Viewer軟件優(yōu)勢(shì)
1、snapgene viewer分析序列結(jié)構(gòu),提取信息,并導(dǎo)出為其他格式
2、在SnapGene Viewer用戶界面中,您可以看到序列圖,包含的酶列表,序列比對(duì),顯示翻譯,存儲(chǔ)有關(guān)特征和底物的詳細(xì)信息,以及查看項(xiàng)目歷史。所有您需要做的是在支持的視圖之間導(dǎo)航。
3、SnapGene Viewer還集成了序列注釋功能和多個(gè)共享和導(dǎo)出選項(xiàng)。您可以依靠SnapGene格式傳播觀察結(jié)果,也可以使用GenBank,DDBJ,EMBL,F(xiàn)ASTA或純文本格式導(dǎo)出表示。
4、大部分SnapGene Viewer窗口保留用于可視化表示,而布置在畫布區(qū)域上的按鈕可讓您與序列交互并處理數(shù)據(jù)??梢酝ㄟ^(guò)SnapGene Viewer狀態(tài)欄菜單訪問(wèn)附加功能,但請(qǐng)注意,其中很少的功能帶有分配的熱鍵。
SnapGene Viewer安裝步驟
1、在華軍軟件園將SnapGene Viewer下載下來(lái),并解壓到當(dāng)前文件夾中,點(diǎn)擊其中的snapgene_viewer_4.0.4_win.exe應(yīng)用程序,選擇軟件安裝位置界面,華軍小編建議用戶們安裝在D盤中,選擇好安裝位置點(diǎn)擊下一步。
2、接著我們來(lái)到安裝界面,我們需要點(diǎn)擊install開始安裝。
3、SnapGene Viewer安裝結(jié)束,點(diǎn)擊完成即可。
SnapGene Viewer支持格式
DNA Files(*.DNAS;*.ape;*.cm5;*.cow;*.dat;*.dna;*.dna;*.ebl;*.editseq;*.emb;*.embl;*.exdna;*.fa;*.fas;*.fasta;*.ffn;*.fna;*.fsa;*.gb;*.gbank;*.gbk;*.gbs;*.gbwithparts;*.gcc;*.gcs; *.gen;*.genbank;*.gp;*.mol;*.mpd;*.mv;*.mvn;*.nt;*.nucl;*.pd4;*.pdw;*.rtf;*.sbd;*.seq;*.txt;*.vcd;*.xdgn;*.xdna;*.xml)
Protein Files (*.prot)
Sequence Trace Files (*.ab1;*.abd;*.abf;*.abi;*.alf;*.ctf;*.scf;*.ztr)
Archive Files (*.ma4)
SnapGene DNA (*.dna)
SnapGene Protein (*.prot)
SnapGene Viewer使用方法
引物、PCR和突變繪制怎么操作
1.PCR引物繪制:在多克隆位點(diǎn)處找到合適的兩個(gè)酶切位點(diǎn)。如BamHI和XbaI,在目的基因兩側(cè)截取15-30bp序列,點(diǎn)擊Primers→Add primers,選擇top strand或bottom strand,如圖:
給該引物命名,然后點(diǎn)擊Insertion,在該引物上添加之前選擇好的酶切位點(diǎn)序列,如圖選擇了BamHI,點(diǎn)解Insert:
然后在該序列5’端上添加數(shù)個(gè)堿基作為保護(hù)堿基。點(diǎn)擊完成。
△下游引物設(shè)計(jì)相同,不再贅述。
2.突變引物繪制:在目的基因上截取一小段包含要突變位點(diǎn)的序列,點(diǎn)擊Primers→Add primers,為該引物命名,在5’序列突變位點(diǎn)的三個(gè)堿基畫黑,如圖:
點(diǎn)擊Insertions,選擇突變成的氨基酸,點(diǎn)擊Insert。即可獲得該突變引物,點(diǎn)擊Reverse Complement,可獲得反向引物。
SnapGene Viewer常見(jiàn)問(wèn)題
問(wèn):我的組織可以分發(fā)SnapGene格式的文件嗎?
答:絕對(duì)。該格式是作為可視化,注釋和共享DNA序列的國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)而開發(fā)的。使用SnapGene或免費(fèi)的SnapGene Viewer創(chuàng)建的文件可以不受學(xué)術(shù)或商業(yè)團(tuán)體的限制而分發(fā)。SnapGene Viewer是免費(fèi)提供的,因此您的同事或客戶將能夠打開文件。
問(wèn):SnapGene可以讀取我目前的分子生物學(xué)軟件創(chuàng)建的文件嗎?
答:我們不斷增強(qiáng)SnapGene讀取其他文件格式的能力。目標(biāo)是不僅導(dǎo)入DNA序列,還導(dǎo)入注釋。要查看您的格式是否受支持,請(qǐng)?jiān)L問(wèn)我們的文件兼容性頁(yè)面。
問(wèn):如何卸載snapgene viewer?
答:方法一:安裝并打開電腦管家軟件,選擇進(jìn)入軟件管理選項(xiàng),點(diǎn)擊卸載選項(xiàng),在列表中找到snapgene viewer,點(diǎn)擊卸載即可
方法二:安裝并打開360軟件管家,在卸載選項(xiàng)的列表中找到snapgene viewer,點(diǎn)擊卸載即可
同類軟件對(duì)比
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